Rui Jesus é professor adjunto no Departamento de Engenharia Eletrónica, Telecomunicações e Computadores do ISEL/IPL desde 2002 onde leciona temas nas áreas de produção de conteúdos multimédia, interação pessoa-máquina e computação móvel. É também coordenador do mestrado em Engenharia Informática e Multimédia.
É membro do centro de investigação, NOVA LINCS, Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade NOVA de Lisboa (grupo de Sistemas Multimodais) onde realiza atividades de investigação nas áreas de processamento de informação multimédia e interação multimodal. Os principais temas de investigação são a sumarização de imagens e vídeos em memórias pessoais e coletivas e a exploração de interfaces naturais para entretenimento, património cultural e comunicação de riscos de desastres naturais.
Esteve envolvido em diversos projetos de pesquisa com outros centros de investigação e com empresas, como LeucoDiff, DigiT FUP, VideoFlow, InStory, Crossing Borders e Crush. É autor e coautor de várias publicações em jornais e conferências com revisão por pares.
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