O Conselho Permanente é o órgão que apoia o Presidente do ISEL no âmbito da gestão de recursos humanos, recursos materiais e espaços físicos dos Departamentos e das Unidades de Investigação e Desenvolvimento. (Estatutos do ISEL, Secção IV, Artigo 31.º)
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Constituição
Presidente: José Nascimento
João Alfredo Santos (Presidente do Conselho Técnico-Científico), Sandra Aleixo (Presidente do Conselho Pedagógico), António Gorgulho (Presidente do Departamento de Engenharia Civil), Manuel Barata (Presidente do Departamento de Engenharia Eletrónica e Telecomunicações e de Computadores), Fernando Nunes (Presidente do Departamento de Engenharia Eletrotécnica de Energia e Automação), João Calado (Presidente do Departamento de Engenharia Mecânica), Paula Robalo (Presidente do Departamento de Engenharia Química), Pedro Patrício (Presidente do Departamento de Física), José Leonel Rocha (Presidente do Departamento de Matemática)